精子畸形率98%还是比较严重的，容易引起胚胎停止发育，甚至导致不孕。

正常精子畸形率在2%左右，如果精子畸形率达到98%，说明病情比较严重，这种情况精子很难和卵子进行结合，造成怀孕几率大大降低，严重的会导致不孕。即便精子和卵子结合成受精卵，由于精子畸形，受精卵质量也不高，容易造成胚胎停止发育。造成精子畸形率高的原因比较多，比如长期射线影响、药物因素以及染色体异常、生殖系统感染等。

如果是由于泌尿生殖系统感染引起的精子畸形率高，可以在医生的指导下服用敏感度高的抗生素药物，比如阿莫西林胶囊、头孢克肟片。如果是精索静脉曲张导致的，可以考虑进行手术治疗，比如精索静脉高位结扎术。同时戒除抽烟喝酒不良习惯，远离有毒有害有辐射性的环境。